ID: 614
Titel: COVID-19: kliniska symtom i relation till virologiska, immunologiska och cellulära biomarkörer
Provsamlingsansvarig: Magnus Gisslén
Start insamling: 2020-04-22
Slut insamling: 2030-04-22
Beskrivning: I december 2019 upptäcktes i Wuhan, Kina ett utbrott med ett nytt coronavirus som fått namnet severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Viruset har sedan dess spridit sig till stora delar av världen och klassificeras nu som en pandemi. Några av de värst drabbade länderna i nuläget är Italien och Spanien. Vi ser nu ett ökat antal avlidna och patienter som behöver intensivvård även i Sverige. 
 
Sjukdomsbilden som SARS-CoV-2 ger upphov till kallas coronavirus disease (COVID-19). Svårighetsgraden varierar från mycket milda symptom från övre luftvägarna till svår viral pneumoni med respiratorisk svikt. Cirka 80% drabbas av mild sjukdom, 15% av svår och 5% av kritisk sjukdom. 
 
Det första fallet av COVID-19 i Sverige diagnosticerades 31 januari 2020 och vi har i dagsläget (2 april 2020) 4 947 personer som testats positiva för SARS-CoV-2, men mörkertalet är stort och Folkhälsomyndigheten bedömer att det finns en allmän spridning i stora delar av landet. 
 
Eftersom detta är en ny typ av infektion är det mycket som är okänt, och direkta paralleller kan inte dras till andra infektioner orsakade av coronavirus då de antingen är mindre allvarliga (vanlig förkylning) eller betydligt allvarligare (SARS och MERS). Vi behöver förstå vilka patienter som är på väg att försämras eller förbättras, vilka immunologiska mekanismer som kan förvärra sjukdomen, kan angripas med olika läkemedel, och på sikt förstå hur långlivat immunolgiskt minne, och därmed försvar mot att få samma infektion igen, utvecklas och kan följas. Det senare är viktigt för att veta vilka personer som kan anses skyddade mot att re-infekteras, men också för att kunna utveckla vacciner.  
 
För att kunna göra det kommer vi att samla in prover från patienter som vårdas på infektionsklinik och/eller får intensivvård, och från sjukhuspersonal. Återkommande prover kommer att tas och vi kommer att spara serum, plasma och infrysta celler i en biobank. Dessa prover kommer sedan att analyseras för att bestämma sammansättningen av celler och undersöka immunologiska mekanismer som minnesceller och skyddande antikroppar, samt virologiska och cellskade-markörer. Slutligen kommer en mindre andel av patienterna att analyseras med modern teknologi i form av single-cell RNASeq, en metod som gör det möjligt att analysera förändringar i patienter mycket brett vilket kan leda till att vi identifierar nya, och oväntade, mekanismer som kan användas för att angripa infektionen. 3

PROVTYP;PROVGIVARE
blod;500
svabb näsa/svalg;500
urin;500
svabb feaces;500
celler;100
cerebrispinalvätska;50