ID: 50 Titel: Identifiering av patogenetiska faktorer vid medfödd hjärtsjukdom Provsamlingsansvarig: Britt-Marie Ekman Joelsson Start insamling: 2015-04-01 Slut insamling: - Beskrivning: MÅLSÄTTNING Målet far projektet är att identifiera genetiska och biokemiska faktorer som kan bidra till uppkomst av strukturella hjärtfel, kardiomyipatier och arytmier och användas som biomarkörer, Projektet syftar vidare till att förstå om specifika genetiska varianter har betydelse för prognos och långtidsutfall för patienterna. BAKGRUND Trots internationella forskningsframsteg under de senaste åren avseende olika faktorers betydelse för uppkomsten av medfödda hjärtfel, är orsakssambanden fortfarande i Stor utsträckning okända. För att förstå hur medfödda hjärtfel uppkommer krävs en bred ansats för att samla studiepopulationer av tillräcklig storlek samt även möjligheten att involvera både barn och deras familj för att erhålla ett tillräckligt antal fall och en provsamling som medger genetiska analyser. Huvudsyftet med insamlandet av en svensk nationell provsamling från barn-och ungdomar med hjärtsjukdom, är dels att förstå patogenesen och dels att prospektivt kunna studera samband mellan olika faktorer före och i samband med födelsen och relationen till kliniska sjukdomsyttringar - för att på sikt förebygga hjärtsjukdom samt förbättra diagnostik och behandling inom denna patientgrupp. De senaste åren har det blivit allt tydligare att denna typ av ansats avseende barnhjärtsjukdomar kommer att vara av stoft värde och provsamlingar etableras nu i många länder. Internationella exempel på biobanker för medfödda hjärtfel är bl.a. Ihe Kids Heart Research DNA Bank i Australien, Pediatric Cardiac Genomics Consortium (PCGC) I CSA, German Biobank for congenital heart defects i Tyskland och The CONCOR registry i Nederländerna (GUCH). ARBETSPLAN 1) Patienter med medfödda hjärtsjukdomar i form av strukturella hjärtfel, samt kardiomyopatier och arytmier identifieras och karaktäriseras kliniskt via lokala register vid Barnkardiologiska klinikerna vid Karolinska Universitetssjukhuset, Norrlands universitetssjukhus, Linköpings Universitetssjukhus, Sahlgrenska Universitetssjukhuset, Skånes universitetssjukhus samt via det barnkardiologiska kvalitetsregistret SWEDCON. Barn med hjärtsjukdom och dess föräldrar erbjuds deltagande i studien i samband med barnets ingrepp/operation vid respektive deltagande 2) Deltagande i studien sker genom att Föräldrarna a) lämnar uppgifter om sin hälsa b) lämnar blod (IO ml) och/eller salivprov för framrening av serum, plasma och I)NA Barnet a) lämnar blod (5-10 ml) för framrening av serum, plasma och DNA Blodprovet på barnet tas i samband med vårdtillfälle vid barnhjärtkirurgi/kateterisering eller Sjukvårdsbesök. b) Peroperativt avlägsnad hjärtvävnad tillvaratas. Den vävnad Som tillvaratas utgörs av vävnad avlägsnad under det kliniskt indicerade ingreppet och inbegriper förmaksvävnad från den tobakspungssutur som genomförs för kanyleringperoperativt, samt vävnad avlägsnad på kirurgisk indikation (vilken annars kasseras). Ingen extra vävnad tas i forskningssyfte. 3) Proverna tillvaratas och förvaras vid etablerade biobanksfaciliteter vid Karolinska Universitetssjukhuset/Karolinska Institutet, Sahlgrenska Universitetssjukhuset och Region Skåne. 4) Insamlade prover utgör en provsamling där flera principiellt olika analyser för att finna biomarkörer och gener relaterade till utveckling av medfödd hjärtsjukdom utförs: a) kandidatgener analyseras Med denna ansats testas om varianter av gener som identifierats Som troliga kandidater verkligen år relaterade till ökad känslighet för medfött hjärtfel, kardiomyopati och arytmisjukdom. Exempel år transkriptionsfaktorer såsom GA'l'A4, GAT A6, , TBX5. b) "whole genome scans" med SNP (single nucleotide polymorphism) och copy number teknik utförs, liksom epigenetiska analyser. Denna ansats har ffrdelen att sökandet är förutsättningslöst och även inte tidigare föreslagna kandidater kan identifieras. c) Hel-genom sekvensering utförs. Denna ansats har rördelen att sökandet är förutsättningslöst och även inte tidigare föreslagna kandidater kan identifieras, inklusive polymorfier som ej finns representerade på chip använda under b. 5) Serum och plasma analyseras med metoder som ELISA och mass-spektrometri avseende proteiner, metaboliter och lipider. BETYDELSE Behovet av en provsamling för medfödda hjärtsjukdomar har blivit alltmer tydligt och angeläget för atl bättre förstå dessa sjukdomars uppkomst, prognos och optimera och utveckla behandling. Sverige är idag ett av de ledande ländema vad gäller barnhiärtkirurgi och överlevnad och det finns idag fler vuxna med medfödd hjärtsjukdom än bam. Ökad kunskap kring pat0Ccnes och prognostiska markörer är således av stort värde för att på bästa Sått kunna utveckla vård och behandling. PROVTYP;PROVGIVARE helblod;1000 serum;1000 plasma;1000 vävnad;1000 DNA;1000 saliv;1000