ID: 355
Titel: The clinical utility of liquid biopsies – the Gothenburg breast cancer ctDNA project (Värdet av cirkulerande tumör-DNA – Göteborg bröstcancer ctDNA projekt)
Provsamlingsansvarig: Barbro Linderholm
Start insamling: 2018-01-01
Slut insamling: 2021-01-31
Beskrivning: Stora framstegs har gjorts för patienter med en primär (första) bröstcancer lokaliserad till bröstet. Detta beror bland annat på införande av ett flertal behandlingar (cellgiftsbehandling, antihormonell behandling, antikroppsbehandlingar) som ges efter operation för att förhindra återfall. Molekylär karakterisering av cancer görs inom klinisk rutin på vävnad t.ex. den opererade brösttumören. Detta ger viktig biologisk information om brösttumören som är vägledande vid val av behandling. När denna är bortopererad finns inget kvar att undersöka. 
Behandlingrekommendationen för den enskilda patienten baseras på data från meta-analyser och inte på individnivå och om patienten rekommenderas t.ex. cytostatikabehandling är typ av cytostatika och antal behandlingar samma för alla patienter. Behandlingen ges utan att vi kan utvärdera effekten - oftast är tumören redan bortopererad. Detta leder förstås till felbehandling (patienten får en behandling som är ineffektiv vilket ökar risken för återfall och spridd bröstcancer som inte går att bota) eller överbehandling (patienterna skulle kunna få mindre behandling utan att detta påverkar prognosen negativt).
Under uppföljningsperioden görs idag inga regelbundna röntgenundersökningar eftersom bröstcanceråterfall kan komma efter 1-15 år. Utredning görs idag när patienten söker för symptom och då finns oftast omfattande spridning med metastaser i lunga, lever, buk, hjärna och/eller skelett. Tidig upptäckt av återfall med enstaka metastaser har dock en betydligt bättre prognos varför detta skulle vara önskvärt.
För patienter med ärftlighet för bröstcancer som ännu inte insjuknat finns kontrollprogram med röntgen (mammografi, ultraljud och MR fördelade på 1/2 gånger per år). Detta har lett till en tidigare diagnosticering men inte sällan diagnosticeras sjukdomen mellan 2 kontroller. Även här skulle en tidig upptäckt vara av värde med bättre prognos för patienterna.
Sammanfattningsvis skulle en känslig metod som baseras på blodprov vara önskvärt.
Våra mål är att undersöka om cirkulerande tumör-DNA (ctDNA) med en ny mycket känslig metod utvecklad i Docent Andres Ståhlbergs grupp kan vara en metod för att tidigt upptäcka resistens/känslighet till behandling eller återfall vid bröstcancer. SiMSen-Seq:“Simple, Multiplexed, PCR-based barcoding of DNA for Sensitive mutation detection using Sequencing’’ kan identifiera mutationsfrekvenser mindre än  0.1%. Tidigare diagnos av ärftlig bröstcancer är också önskvärt. Frågeställningar:
1.) Korrelerar en reduction av ctDNA 1 dygn efter den första cytostatika-kuren till behandlingseffekt?  
2.) Är kvarvarande ctDNA efter avslutad adjuvant behandling med cytostatika (cellgifter) eller antikroppsbehandling riktad mot HER2-receptorn en markör för mindre effekt av behandlingen? Ökar detta risken för återfall?
3.) Är detekterbart ctDNA under uppföljningen ett tecken på tidigt återfall?  
4.) Kan detekterbart ctDNA under kontrollprogram för patienter med ärftlighet för bröstcancer vara ett tidigt tecken på insjuknade? 
Metoder: 
Blodprov (2 x 9 mL i EDTA rör) för preparering av plasma tas före start av kurativt syftande behandling för primär bröstcancer; 1 dygn efter 1:a kuren med cytostatika / cytostatika + målstyrd behandling /målstyrd behandling) då behandlingen avslutas. Prov insamlas också under uppföljningsperioden enligt bifogat schema i forskningsprogrammet. För patienter som går i kontrollprogram p.g.a. ärftlighet för bröstcancer tas prover 2 gånger/år. 10 snitt från patients bröstcancer undersöks för molekylär karakterisering av tumören och de vanligaste mutationerna väljs för att sedan utgöra basen för riktade analyser med den känsliga SimSeq metoden som används vid analyser av blodproven. Alla analyser och databearbetning sker på Sahlgrenska Cancercentrum. 
Resultaten analyseras i relation till klinikst utfall vilket inhämtas från deltagande kliniker (onkolog- och kirurgklinikerna på Sahlgrenska US).

PROVTYP;PROVGIVARE
plasma, (EDTA) Antal avser per år;600